Journal of Aquaculture Development

fa شناسایی گونه‌های لاکتوباسیل مزوفیل موجود در روده ماهیان سفید (Rutilus kutum Kamensky, 1901) دریای خزر با تست تأییدی PCR Identification of mesophilic lactobacillus species in the intestine of Rutilus kutum fish in Caspian Sea with PCR test تخصصي Special كاربردي Applicable لاکتوباسیلها گونههای باکتری گرم مثبت، بدون اسپور، کاتالاز منفی میلهای می‌باشند که دارای نقش اکولوژیکی مهمی در دستگاه گوارش میباشند که شامل تولید مواد ضدمیکروبی، افزایش پاسخ سیستم ایمنی و افزایش قابلیت دسترسی مواد مغذی است. جهت شناسایی لاکتوباسیلهای موجود در روده ماهیان سفید اقدام به صید تعداد 40 قطعه ماهی به‌صورت تصادفی از دریای خزر گردید. سپس نمونهها تحت شرایط استریل و در مجاورت یخ به آزمایشگاه میکروبشناسی دانشکده دامپزشکی دانشگاه آزاد واحد تبریز منتقل و بعد از بررسی فنوتیپیکی و بیوشیمیایی، 10 نمونه لاکتوباسیل موردنظر برای تشخیص گونه‌ها بر اساس ساختار مولکولی ژن srDNA 16، اقدام به استخراج DNA و شناسایی لاکتوباسیلها با پرایمر اختصاصی نموده و سپس به‌منظور شناسایی اولیه گونهها از آنزیم برشی Taq1 استفاده گردید. سپس 3 نمونه متفاوت به‌منظور تشخیص قطعی جهت توالی یابی ارسال گردید. نتایج توالی یابی حاکی از تشابه 99-97% توالیهای موردنظر با توالیهای ژن‌های SrDNA 16 ثبت‌شده در بانک اطلاعاتی برای گونه لاکتوباسیلوس فرمنتوم بود و تنها یک نمونه تشابه 89% با گونه لاکتوباسیلوس فرمنتوم (Lactobacillus Fermentum) داشت که نمونه موردنظر برای توالی یابی به‌صورت پارشیال فرستاده شد و بعد توالی یابی با شماره ژن JQ906262 تحت عنوان Lactobacillus sp. RU1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence در سایت ncbi ثبت شد.          Lactobacilli strains are Gram-positive, non-spore, catalase-negative rods bacteria that have an important ecological role in the digestive tract including Production of antimicrobial substances, Enhance the immune response and Increase nutrient availability. To identify lactobacilli in the gut of  Rutilus frisii kutum fish, 40 fish were randomly catch from the Caspian Sea. The samples under sterile conditions and ice transferred to microbiology in Tabriz Branch Islamic Azad university and After phenotypic and biochemical test, Lactobacillus samples to make a diagnosis based on the molecular structure of the gene for srDNA 16, DNA extracted and take action to identify lactobacilli with specific primers and Then for the early identification of species, Taq1 restriction enzymes were used. Then three different samples for sequencing were sent for diagnosis. The results of sequencing showed that 99-97% sequence similarity to the gene sequence database for the species Lactobacillus fermentum SrDNA 16 recorded. Just one example of the similarity of 89% of the species Lactobacillus fermentum the sample for sequencing as partial was sent. After sequencing the gene number JQ906262 as Lactobacillus sp. RU1 16S ribosomal RNA gene, partial sequence was recorded on ncbi.   لاکتوباسیلوس, ماهی سفید, مزوفیل lactobacillus, Rutilus frisii kutum, mesophilic 35 44 http://aqudev.lahijan.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-265-1&slc_lang=fa&sid=1 Pouya Khoshkhial Saber پویا خوش خیال صابر pouya.saber@yahoo.com 10031947532846004709 10031947532846004709 No Department of Food Hygiene and Aquatic, Faculty of Veterinary Medicine, Tabriz Branch, Islamic Azad University, Tabriz, Iran گروه بهداشت مواد غذایی و آبزیان، دانشکده دامپزشکی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران Sayed Javid Mortazavi Tabrizi سید جاوید مرتضوی تبریزی j.mortazaci@iaut.ac.ir 10031947532846004710 10031947532846004710 Yes Department of Food Hygiene and Aquatic, Faculty of Veterinary Medicine, Tabriz Branch, Islamic Azad University, Tabriz, Iran گروه بهداشت مواد غذایی و آبزیان، دانشکده دامپزشکی، واحد تبریز، دانشگاه آزاد اسلامی، تبریز، ایران