fa مقایسه عملکرد واکنش زنجیره‌ای پلیمراز چندگانه بهینه‌سازی شده با کیت استاندارد (IQ2000) جهت تشخیص ویروس لکه سفید در میگو تخصصي Special كاربردي Applicable <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="direction:rtl"><span style="unicode-bidi:embed"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black">&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp;&nbsp; یکی از علل مرگ و میر گسترده در میگوهای پرورشی در مزارع بیماری ویروسی لکه سفید است و باعث تلفات سریع و زیاد در ظرف چند روز می شود، تشخیص به موقع مانع ضرو زیان گسترده مالی می&shy;شود. تنها روش تشخیص زودهنگام و مطمئن این ویروس روش مولکولی است از ژنوم ویروس برای ناحیه </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">VP28</span></span></span><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black"> و ناحیه مرتبط با پروتیین کیناز و از ژنوم میگو برای نواحی </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">s</span></span></span><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black">18 ریبوزومال به عنوان کنترل داخلی آغازگرهایی سازگار با هم طراحی شدند. پس از بهینه سازی آغازگرها به صورت </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">multiplex</span></span></span><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black"> جهت تشخیص ویروس لکه سفید، </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">DNA</span></span></span><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black"> استخراج شده از 200 نمونه میگوی مشکوک به بیماری توسط دو کیت بهینه‌سازی شده و مرجع </span></span><span dir="LTR" style="font-size:10.0pt"><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:black">IQ2000</span></span></span><span b="" lang="FA" style="font-family:" zar=""><span style="color:black"> (تایوانی) مقایسه گردید. از این تعداد، 94 نمونه مثبت (آلوده به ویروس) و 106 نمونه منفی بود، که با نتایج بدست آمده با کیت مرجع بجز در 2 نمونه مطابقت داشت. حساسیت و اختصاصیت کیت طراحی شده در مقایسه با کیت مرجع به ترتیب 98 و 100 درصد می‌باشد. با توجه به نتایج بدست آمده روش بهینه سازی شده تک مرحله ای این مطالعه می&shy;تواند جایگزین یا به همراه کیت مرجع استفاده شود.</span></span></span></span></span></span></span> <span style="font-size:11pt"><span style="line-height:normal"><span style="font-family:Calibri,sans-serif"><i>&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;</i><span new="" roman="" style="font-family:" times=""><span style="color:#222222">One of the main causes of widespread mortality in farmed shrimp is the white spot syndrome virus (WSSV), which can lead to rapid and significant losses within just a few days. Timely diagnosis can prevent extensive financial losses. The only reliable early detection method for this virus is molecular. Primers compatible with each other were designed from the viral genome for the VP28 region and the protein kinase-related region, and from the shrimp genome for the S18 ribosomal region as an internal control. After optimizing the primers for multiplex detection of WSSV, DNA extracted from 200 shrimp samples suspected of being infected with the virus was compared using two optimized kits and the IQ2000 reference kit (from Taiwan). Of these, 94 samples tested positive (infected with the virus) and 106 samples tested negative, with results matching the reference kit except for two samples. The sensitivity and specificity of the designed kit, compared to the reference kit, were 98% and 100%, respectively. Based on these results, the optimized one-step method from this study can be used as a replacement for or in conjunction with the reference kit.</span></span></span></span></span> ویروس لکه سفید, واکنش زنجیره ای پلیمراز چندگانه, تشخیص, میگو, IQ2000 White Spot Virus, Multiplex Polymerase Chain Reaction, Detection, Shrimp, Optimization, IQ2000. 77 90 http://aqudev.lahijan.iau.ir/browse.php?a_code=A-10-573-1&slc_lang=fa&sid=1 Hossein Moein حسین معین hnmoein@yahoo.com 100319475328460010668 100319475328460010668 No Department of Microbiology, Jahrom Branch, Islamic Azad University, Jahrom, Iran. دانشگاه آزاد اسلامی واحد جهرم Farshid Kafilzadeh فرشید کفیل زاده f.kafilzadeh@gmail.com 100319475328460010669 100319475328460010669 Yes Department of Microbiology, Jahrom Branch, Islamic Azad University, Jahrom, Iran. 2-گروه میکروبیولوژی، واحد جهرم، دانشگاه آزاد اسلامی، جهرم، ایران Mohammad Khalil Pazir محمد خلیل پذیر 100319475328460010670 100319475328460010670 No National Shrimp Research Institute, Iranian Fisheries Science Research Institute, Agricultural Research, Education, and Extension Organization (AREEO), Bushehr, Iran پژوهشکده میگو کشور Mohammadrez Miri محمدرضا میری 100319475328460010671 100319475328460010671 No Persian Gulf Marine Biotechnology Research Center, Persian Gulf Biomedical Sciences Research Institute, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran. دانشگاه علوم پزشکی بوشهر Tahmineh Nowrouzi تهمینه نوروزی t.nowrouzi91@gmail.com 100319475328460010672 100319475328460010672 No Persian Gulf Marine Biotechnology Research Center, Persian Gulf Biomedical Sciences Research Institute, Bushehr University of Medical Sciences, Bushehr, Iran. دانشگاه علوم پزشکی بوشهر